Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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