Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms