Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms