Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms