Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms