Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms