Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms