Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms