Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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