Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms