Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms