Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOPXQ9BPY8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms