Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms