Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGREF1Q99674 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms