Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms