Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms