Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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C2orf48Q96LS8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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C2orf48Q96LS8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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C2orf48Q96LS8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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C2orf48Q96LS8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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