Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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