Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms