Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms