Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms