Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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