Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms