Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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