Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms