Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms