Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms