Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms