Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms