Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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