Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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