Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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