Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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