Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms