Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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