Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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