Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHBQ15464 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHBQ15464 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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