Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SYCP1Q15431 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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