Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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