Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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