Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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