Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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