Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLCA4Q14CN2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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