Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RFTN1Q14699 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RFTN1Q14699 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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