Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms