Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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