Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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