Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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