Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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