Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms